نجح محمد عبد الستار السيد في تطويع المؤسسة الدينية لصالح سياسة نظام بشار الأسد، وانتزع صلاحيات واسعة أنيطت بوزارة الأوقاف حتى تحول إلى شخصية فريدة بين رجال الدين الذين هيمنوا على مفاصل الدولة بشكل غير مسبوق.